Yapısal Artırılmış IC50 Veri Tabanı (SAIR) ile Yapı Zekası Destekli İlaç Keşfi
Kaynak: huggingface.co ·
SandboxAQ, ilaç araştırma ve geliştirmesindeki uzun süreli veri kıtlığını aşmak amacıyla Yapısal Artırılmış IC50 Veri Tabanı'nı (SAIR) yayınladı. Bu veri tabanı, deneysel olarak ölçülmüş IC50 etiketleriyle eşleştirilmiş 5.24 milyon farklı 3 boyutlu protein-ligand kompleksi içermektedir. CC BY 4.0 lisansıyla tamamen ücretsiz olarak erişime sunulan veri seti, ticari ve ticari olmayan AR-GE süreçlerinde kullanılabilmektedir. Yapıların yüzde 97'si PoseBusters testlerinde doğrulama kontrollerinden geçmiştir.
Neden önemli?
Bu açık kaynaklı veri seti, geleneksel ıslak laboratuvar süreçlerinden bilgisayar destekli hesaplamalara geçişi hızlandırarak ilaç keşif sürelerini kısaltır. Daha önce deneysel yapıları bulunmayan karanlık proteom hedeflerinin incelenmesine olanak tanır.
Bununla neler yapılabilir?
- Olası kullanım: Araştırmacılar, SAIR veri setini Hugging Face üzerinden indirerek yeni yapay zeka modellerini eğitebilir ve kıyaslayabilir.
- Olası kullanım: Biyoteknoloji ekipleri, in silico tarama ve aday optimizasyonu süreçlerinde veri setini kullanarak laboratuvar maliyetlerini düşürebilir.
Somut sonuçlar ve kanıtlar
- SAIR veri setindeki yapıların yüzde 97'si PoseBusters testlerinde tüm kontrolleri geçmiştir. (Üreticinin açıklaması)
- 760 adet NVIDIA H100 işlemciden oluşan küme üzerinde Boltz1 modeli kullanılarak %95'ten fazla GPU hesaplama verimliliği elde edilmiştir. (Üreticinin açıklaması)
Sınırlar ve açık kalan sorular
Veri seti büyük boyutlu sıkıştırılmış arşivler halinde sunulmaktadır ve her bir arşiv yaklaşık 10 GB civarındadır. İlgili dosyaların indirilmesi ve işlenmesi için uygun donanım ve altyapı gereklidir.